Вы находитесь в городе : Шымкент
Полноэкзомное секвенирование.
Синонимы: Исследование панели генов мышечных дистрофий, миопатий, болезней ионных каналов и нейромышечного синапса по результатам полноэкзомного секвенирования; Полноэкзомное секвенирование панели генов мышечных дистрофий, миопатий, болезней ионных каналов и нейромышечного синапса; Мышечные дистрофии и их генокопии; Миопатии и их генокопии; Метаболические миопатии; Болезни ионных каналов; Врожденные миастении; Митохондриальные миопатии (ядерная ДНК); Артрогрипоз.
Study of gene panel of muscular dystrophies, myopathies, ion channel diseases, and neuromuscular junction disorders using whole-exome sequencing; Whole exome sequencing of gene panel for muscular dystrophies, myopathies, ion channel diseases, and neuromuscular synapse disorder.
Что такое полноэкзомное секвенирование?
Полноэкзомное секвенирование – это высокотехнологичный метод анализа ДНК, прочитывающий все белок-кодирующие участки генома (экзом), содержащие ~85% известных мутаций (патогенных вариантов). Полноэкзомное секвенирование выявляет:
Когда исследование затруднено
Выявление некоторых типов вариантов методом экзомного секвенирования затруднено или невозможно. К таким вариантам относятся:
Метод имеет ограниченную чувствительность в отношении вариантов в состоянии мозаицизма.
Что такое мышечные дистрофии и миопатии?
Мышечные дистрофии – это группа наследственных заболеваний, которые приводят к прогрессирующей слабости и атрофии мышц вследствие нарушения их структуры и функции. Основным признаком является мышечная слабость, которая со временем нарастает. Преимущественно поражается скелетная мускулатура, также могут поражаться дыхательные мышцы и сердце.
Наиболее часто встречающиеся мышечные дистрофии:
Врожденные миопатии представляют собой клинически и генетически гетерогенную группу мышечных заболеваний, вызванных структурными аномалиями скелетных мышц, с характерными специфическими патоморфологическими изменениями в них. В большинстве случаев болезнь начинается в раннем детстве или в первые два года после рождения с выраженной гипотонии мышц («вялый ребенок») и проксимальной мышечной слабости. В клинической картине часто преобладает врожденная гипоплазия отдельных мышц над атрофией мышц. Отсутствует корреляция между генотипом и фенотипом – патогенные варианты в одном и том же гене могут вести к развитию различных клинических фенотипов. Миопатии классифицируются по гистологическим признакам.
Наиболее часто встречающиеся формы врожденных миопатий:
Диагноз устанавливается на основании клинической картины, биопсии мышц и молекулярно-генетического исследования. Миопатии отличаются от мышечных дистрофий по возрасту манифестации заболевания, распределению пораженных мышц и отсутствию характерных для миодистрофий дистрофических изменений.
Метаболические миопатии ─ это группа редких генетических заболеваний, связанных с нарушениями внутриклеточного энергетического обмена, которые вызывают поражение мышц. Они включают широкий спектр заболеваний с гетерогенными проявлениями, варьирующимися от тяжелых системных, приводящих к смерти в младенческом возрасте, до заболеваний с поздним началом у взрослых и умеренно выраженными симптомами.
Описано три основных вида метаболических миопатий:
К гликогеновым миопатиям относят болезнь Помпе, болезнь Кори-Форбса, болезнь Мак-Ардля, болезнь Таруи, болезнь Данона и др. Миопатии, связанные с нарушением метаболизма липидов, могут приводить к рабдомиолизу. Митохондриальные миопатии могут проявляться мышечной слабостью, мышечными болями, рабдомиолизом.
Болезни ионных каналов (или недистрофические миотонии) – это наследственные мышечные заболевания, которые вызваны нарушениями в работе кальциевых, натриевых, хлоридных и калиевых ионных каналов. К этой группе заболеваний относятся миотония, парамиотония и периодический паралич, для которых характерна задержка в расслаблении мышц следующая за сильным произвольным сокращением.
Миотония обычно провоцируется резким движением после отдыха, к распространенным триггерам относятся воздействие холода и стресс.
Врожденная парамиотония (холодовая миотония Эйленбурга, парадоксальная миотония) характеризуется замедленным расслаблением мышц после сокращения, которое может смениться эпизодами временного паралича («холодовой паралич»).
Врожденные миастенические синдромы – это группа наследственных заболеваний, поражающих нервно-мышечное соединение. Клинически проявляются мышечной слабостью различной степени выраженности. Напоминают миастению, но отличаются от нее по этиологии и патогенезу (врожденные миастенические синдромы вызваны патогенными вариантами генов, кодирующих белки, участвующие в синаптической передаче сигнала, в то время как миастения – это аутоиммунное заболевание). При врожденных миастенических синдромах обычно наблюдается утомляемость, слабость глазных, бульбарных мышц и мышц конечностей, которая проявляется при рождении или вскоре после него, обычно в первые два года жизни.
Митохондриальные миопатии – это клинически и генетически гетерогенная группа наследственных заболеваний мышц, которые возникают в результате нарушения функции тканевого дыхания. Проявляются нарастающей мышечной слабостью, атрофией мышц, прогрессирующими двигательными расстройствами, которые могут сопровождаться судорогами, поражениями сердца, ухудшением слуха и зрения. В данную панель входят только митохондриальные миопатии с дефектом ядерной ДНК.
Артрогрипоз – это тяжелое врожденное генетическое заболевание опорно-двигательного аппарата с контрактурами двух и более суставов нижних и/или верхних конечностей (несмежных областей), как правило, в сочетании с мышечной гипо- или атрофией, поражением мотонейронов спинного мозга, при исключении остальных известных системных заболеваний. Различают следующие клинические формы артрогрипоза:
Полный список исследуемых заболеваний, включенных в панель, представлен в таблице.
Мышечные дистрофии и их генокопии (дистрофия Дюшенна/Беккера, поясно-конечностные миодистрофии и другие) | |
Мышечная дистрофия Дюшенна/Беккера | DMD |
Поясно-конечностные мышечные дистрофии | ANO5, CACNA1S, CAV3, CAPN3, COL6A1, COL6A2, COL6A3, CRPPA, DAG1, DES и другие гены* |
Плече-лопаточно-лицевая мышечная дистрофия 2 типа | DNMT3B, SMCHD1 |
Врожденные мышечные дистрофии (в т.ч. миопатия Ульриха-Бетлема, синдром Уокера-Варбурга, врожденная мышечная дистрофия Фукуямы, врожденная мышечная дистрофия с ригидностью позвоночника) | COL12A1, COL6A1, COL6A2, COL6A3, FKRP, FKTN, GMPPB, LAMA2, LARGE1, POMGnT1, POMT1, POMT2 и другие гены* |
Дистальная мышечная дистрофия (в т. ч. дистальная миопатия Веландера, миопатия Удда, окулофарингодистальная миопатия, миопатия Миоши, дистальная миопатия Лэнга, дистальная миопатия Нонака) | ANO5, DYSF, GNE, LDB3, TIA1, TTN и другие гены* |
Окулофарингеальная миодистрофия | HNRNPA2B1 |
Дистрофия Эмери-Дрейфуса | EMD, FHL1, LMNA, SYNE1, SYNE2, TMEM43 |
Миопатии и их генокопии | |
Немалиновая и «кэп»-миопатия | ACTA1, ACTN2, CFL2, KBTBD13, KLHL40, KLHL41, LMOD3 и другие гены* |
Миопатии со стержнем (миопатия центрального стержня, миопатия с множественными маленькими стержнями и другие) | MEGF10, RYR1, SELENON |
Центроядерная миопатия | BIN1, CCDC78, DNM2, MAP3K20, MTM1 и другие гены* |
Миопатия с диспропорцией мышечных волокон | ACTA1, FXR1, MYH7, MYL2, RYR1, SELENON и другие гены* |
Миотония, парамиотония и периодический паралич | CLCN1, KCNE3, SCN4A |
Миофирбриллярная миопатия | ACTA1, BAG3, CRYAB, DES, DNAJB6, FHL1, FLNC, HSPB8 и другие гены* |
Врожденный фиброз экстраокулярных мышц | COL25A1, KIF21A, PHOX2A, TUBB3 |
Другие врожденные миопатии | ACVR1, CLN3, CNTN1, COQ8A, HACD1, HRAS, JPH1, MB, MSTN и другие гены* |
Метаболические миопатии | |
Болезнь Помпе | GAA |
Болезнь Кори-Форбса | AGL |
Болезнь Мак-Ардля | PYGM |
Болезнь Данона | LAMP2 |
Болезнь Таруи | PFKM |
Другие болезни накопления гликогена (гликогенозы) | ENO3, GBE1, GYG1, GYS1, PGAM2 и другие гены* |
Врожденные нарушения гликозилирования (CDG-синдромы) | DOLK, DPM1, DPM2, MPDU1, PGM1 |
Недостаточность ацил-КоА-дегидрогеназы, в т. ч. множественная (MADD) | ACADVL, ETFA, ETFB, ETFDH |
Дефицит карнитина и нарушения β-окисления жирных кислот | ACAD9, CPT2, SLC22A5, SLC25A20, TANGO2 |
Миопатии, связанные с метаболизмом липидов | ABHD5, CAVIN1, LPIN1, PNPLA2, PNPLA8 |
Миопатии, связанные с энергетическим метаболизмом, в т. ч. дефицит миоаденилатдеаминазы | AMPD1, FLAD1, LDHB, MIPEP |
Другие метаболические миопатии | ADSS1, GLA, LDHA и другие гены* |
Болезни ионных каналов (миотонии и парамиотонии) | |
Гены кальциевых каналов (в т. ч. синдром Броди) | ATP2A1, CACNA1S, ORAI1, STIM1 |
Гены калиевых каналов (в т. ч. синдром Андерсена-Тавила) | ABCC9, KCNJ2, KCNJ5 |
Гены натриевых каналов (в т. ч. парамиотония, гиперкалиемический периодический паралич) | ATP1A2, SCN4A |
Гены хлорных каналов (миотония Томсена-Беккера) | CLCN1 |
Другие ионные каналы и связанные белки (в т. ч. синдром Швартца-Джампела) | HSPG2, KCNA1, KCNE3, KCNJ18 |
Врожденные миастении | |
Пресинаптические | CHAT, MYO9A, RPH3A, SLC18A3, SLC25A1, SLC5A7, SNAP25 и другие гены* |
Синаптические | AGRN, COLQ, LAMA5, LAMB2 |
Постсинаптичекие | CASQ1, CHRNA1, CHRNB1, CHRND, CHRNE, CHRNG, DOK7 и другие гены* |
Другие врожденные миастении | ALG2, ALG14, CHD8, COL13A1, DES, DPAGT1, GFPT1, GMPPB и другие гены* |
Митохондриальные миопатии (ядерная ДНК) | |
Репликация, репарация и транскрипция мтДНК | DNA2, DGUOK, LIG3, MGME1, MRPS25, NSUN3, POLG, POLG2 и другие гены* |
Окислительное фосфорилирование и метаболизм кофакторов | CHCHD10, COQ2, COQ4, COQ6, COQ7, COQ8A, COQ9, COX6A2 и другие гены* |
Транспорт, динамика и протеолиз | AIFM1, FBXL4, PTRH2, SLC25A26, SLC25A42 |
Артрогрипоз | |
Дистальный артрогрипоз | ECEL1, MYBPC1, MYH3, MYH8, PIEZO2, THOC2 и другие гены* |
* Полный алфавитный список исследуемых генов данной панели предоставляется по запросу.
** Список генов в панели может быть незначительно изменен в случае публикации обновленных международных или российских рекомендаций, а также в соответствии с экспертным консенсусом.
С какой целью выполняют исследование
Выполнение полноэкзомного секвенирования целесообразно:
Правила подготовки к исследованию
Специальной подготовки не требуется.
Интерпретация результатов исследований содержит информацию для лечащего врача и не является диагнозом. Информацию из этого раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. Точный диагноз ставит врач, используя как результаты данного обследования, так и нужную информацию из других источников: анамнеза, результатов других обследований и т.д.
Единицы измерения: нет.
Референсные значения: нет.
Формат представления результата
Качественный (указывается для каждого параметра, если их несколько).
Информация по интерпретации предоставляется на отдельном бланке.