Полноэкзомное секвенирование панели генов наследственных дисплазий соединительной ткани (Whole exome sequencing of gene panel for hereditary connective tissue disorders)

Синонимы: Синдром Элерса-Данло и его генокопии; Синдром Марфана и его генокопии; Синдром Луиса-Дитца и егогенокопии; Несовершенный остеогенез; Синдромальные наследственные заболевания аорты; Заболевания аорты при метаболических болезнях накопления; Эластолизис; Синдром Уэйла-Маркезани; Синдром Стиклера; Синдром Нунан.

Ehlers-Danlos syndrome and its genocopies; Marfan syndrome and its genocopies; Louis-Dietz syndrome and its genocopies; Osteogenesis imperfecta; Syndromic hereditary diseases of aorta; Diseases of the aorta in metabolic storage diseases; Elastolysis; Weil-Marchesani syndrome; Stickler syndrome; Noonan syndrome.

Краткое описание исследования «Полноэкзомное секвенирование панели генов наследственных дисплазий соединительной ткани»

Дисплазии соединительной ткани – это генетически обусловленные нарушения, характеризуются дефектами волокнистых структур и основного вещества соединительной ткани, приводящие к нарушению формообразования органов и систем. Имеют прогрессирующее течение, определяющие особенности ассоциированной патологии, а также фармакокинетики и фармакодинамики лекарственных средств (Российское научное медицинское общество терапевтов, 2018).

Формы дисплазий соединительной ткани

Наследственные дисплазии соединительной ткани – это гетерогенная группа моногенных заболеваний, обусловленных генетическими дефектами. К данной группе относятся такие болезни, как:

• синдром Элерса-Данло;
• синдром Марфана;
• синдром Лоенца-Дитца;
• несовершенный остеогенез;
• эластолизис (cutis laxa);
• синдром Стиклера;
• синдром Уэйла-Маркенази.

В симптомокомплекс данных состояний чаще всего включаются:

• гипермобильность суставов;
• повышенная эластичность кожных покровов;
• различные скелетные аномалии;
• пороки развития сердечно-сосудистой системы;
• офтальмологические нарушения;
• специфические для отдельных заболеваний проявления.

Одним из наиболее серьезных осложнений данной группы заболеваний является аневризма и разрыв аорты. В соответствии с международными и отечественными рекомендациями, у пациентов с аневризмами аорты рекомендовано проведение комплексного молекулярно-генетического тестирования, которое должно включать болезни соединительной ткани (синдром Элерса-Данло, синдром Марфана, синдром Лоенца-Дитца и другие), а также несиндромальные генетические причины аневризмы аорты и аортопатию с двустворчатым аортальным клапаном.

Что такое полноэкзомное секвенирование?

Полноэкзомное секвенирование – это высокотехнологичный метод анализа ДНК, прочитывающий все белок-кодирующие участки генома (экзом), содержащие ~85% известных мутаций (патогенных вариантов). Полноэкзомное секвенирование выявляет:

• однонуклеотидные замены (SNV);
• малые инсерции/делеции (in/del) до 50 п.н.;
• некоторые вариации числа копий (CNV).

Когда исследование затруднено

Выявление некоторых типов вариантов методом экзомного секвенирования затруднено или невозможно. К таким вариантам относятся:

• структурные изменения хромосом (инверсии, транслокации, делеции, амплификации);
• полиплоидии;
• анеуплоидии;
• варианты, ассоциированные с протяженными участками триплетных и других повторов;
• варианты в генах с наличием в геноме близкого по последовательности псевдогена или паралога;
• варианты в GC-богатых участках;
• варианты в интронах за пределами канонических сайтов сплайсинга;
• эпигенетические варианты.

Метод имеет ограниченную чувствительность в отношении вариантов в состоянии мозаицизма.

Выполнение полноэкзомного секвенирования показано:

• когда клиническая картина заболевания гетерогенна и предполагает дифференциальный диагноз в рамках широкого спектра генетически-детерминированных заболеваний;
• когда заболевание является наследственным, но количество потенциальных генов-кандидатов велико;
• когда другими базовыми методами (кариотипирование, «точечное» генетическое обследование) не удалось установить причину заболевания, но есть высокая вероятность его генетической природы.

С какой целью выполняют исследование

С целью дифференциальной диагностики дисплазий соединительной ткани и обследования кровных родственников пациента с доказанной генетической формой дисплазии соединительной ткани.

Литература

1. Клинические рекомендации. Аневризмы грудной и торакоабдоминальной аорты. МЗ РФ. – 2025.
2. Клинические рекомендации. Болезнь Помпе. МЗ РФ. – 2025.
3. Клинические рекомендации. Болезнь Фабри. МЗ РФ. – 2024.
4. Мартынов А. И. и др. Дисплазии соединительной ткани [Клинические рекомендации Российского научного медицинского общества терапевтов] //Терапия. – 2018. – №. 6. – С. 10-58.
5. Николаева Е. А., Семячкина А. Н. Гено-фенотипическая характеристика синдрома Элерса-Данло, трудности идентификации типов заболевания и подходы к патогенетическому лечению //Российский вестник перинатологии и педиатрии. – 2021. – Т. 66. – №. 1. – С. 22-30.
6. Asta L. et al. Genetic basis, new diagnostic approaches, and updated therapeutic strategies of the syndromic aortic diseases: Marfan, Loeys–Dietz, and vascular Ehlers–Danlos syndrome //International Journal of Environmental Research and Public Health. – 2023. – Т. 20. – №. 16. – С. 6615.
7. Beyens A. et al. Cutis laxa: a comprehensive overview of clinical characteristics and pathophysiology //Clinical Genetics. – 2021. – Т. 99. – №. 1. – С. 53-66.
8. Deguchi M. et al. Current overview of osteogenesis imperfecta //Medicina. – 2021. – Т. 57. – №. 5. – С. 464.
9. Gouda P. et al. Clinical features and complications of Loeys-Dietz syndrome: A systematic review //International Journal of Cardiology. – 2022. – Т. 362. – С. 158-167.
10. Ostberg N. P. et al. The genetics of thoracic aortic aneurysms and dissection: a clinical perspective //Biomolecules. – 2020. – Т. 10. – №. 2. – С. 182.
11. Yart A., Edouard T. Noonan syndrome: an update on growth and development //Current Opinion in Endocrinology, Diabetes and Obesity. – 2018. – Т. 25. – №. 1. – С. 67-73.
12. Zeigler S. M., Sloan B., Jones J. A. Pathophysiology and pathogenesis of Marfan syndrome //Progress in heritable soft connective tissue diseases. – 2021. – С. 185-206.

Правила подготовки к исследованию

Специальной подготовки не требуется.

Показания для анализа «Полноэкзомное секвенирование панели генов наследственных дисплазий соединительной ткани»:

• подозрение на наличие дисплазии соединительной ткани (синдром Элерса-Данло и его генокопии, синдром Марфана и его генокопии, синдром Луиса-Дитца и его генокопии, несовершенный остеогенез, синдромальные наследственные заболевания аорты, эластолизис, синдром Уэйла-Маркезани, синдром Стиклера, синдром Нунан);
• обследование кровных родственников пациента с доказанной генетической формой дисплазии соединительной ткани.

Интерпретация результатов исследований содержит информацию для лечащего врача и не является диагнозом. Информацию из этого раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. Точный диагноз ставит врач, используя как результаты данного обследования, так и нужную информацию из других источников: анамнеза, результатов других обследований и т.д.

Единицы измерения: нет.

Референсные значения: нет.

Формат представления результата

Качественный (указывается для каждого параметра, если их несколько).

Интерпретация результатов исследования «Полноэкзомное секвенирование панели генов наследственных дисплазий соединительной ткани»

Возможные варианты результата: ПОЛОЖИТЕЛЬНО, ОТРИЦАТЕЛЬНО, СОМНИТЕЛЬНО, или ОБНАРУЖЕНО, НЕ ОБНАРУЖЕНО и пр.

Информация по интерпретации предоставляется на отдельном бланке.