Муковисцидоз, CFTR ч.м.

Синонимы:

Cystic Fibrosis, Gene CFTR, Freq. Mut.

Краткое описание исследования «Муковисцидоз. Поиск частых мутаций в гене CFTR, ч. м.»

Кистозный фиброз (муковисцидоз, МВ) — это аутосомно-рецессивное моногенное наследственное заболевание, характеризуемое поражением всех экзокринных желез, а также жизненно важных органов и систем организма. Частота выявления МВ в РФ составляет 1:4000-1:10000.

Патогенные варианты в гене CFTR вызывают изменение функциональной активности белка, в результате чего нарушается транспорт электролитов и жидкости между эпителиальными клетками и межклеточным пространством. Вследствие этого секрет, выделяемый экзокринными железами, становится чрезмерно густым и вязким. Поражаются железы в бронхах, поджелудочной железе, кишечнике, урогенитальном тракте, потовые и слюнные железы.

Клинические проявления муковисцидоза включают:

• поражения легких (хронический кашель с вязкой мокротой, одышка, частые респираторные инфекции, рецидивирующие бронхиты, пневмонии, бронхоэктазы с формированием дыхательной недостаточности);
• поражения пищеварительной системы вследствие секреторной недостаточностью поджелудочной железы (хроническая диарея, вздутие живота, плохая прибавка веса).

Проявления со стороны мужской репродуктивной системы:

• обструкция и последующая атрезия выносящих протоков яичек;
• азооспермия;
• бесплодие.

К CFTR-ассоциированным состояниям относятся:

• двусторонняя врожденная аплазия семявыносящих путей;
• наследственный CFTR-ассоциированный панкреатит;
• CFTR-ассоциированные диссеминированные бронхоэктазы;
• CFTR-ассоциированный синусит;
• синдром псевдо-Барттера.

С какой целью выполняют исследование

Данное исследование позволяет выявить наиболее частые патогенные варианты гена CFTR, характерные для российской популяции.

Литература

1. Аюпова Г. Р., Минниахметов И. Р., Хусаинова Р. И. Муковисцидоз: современные возможности диагностики и лечения на основе молекулярного патогенеза //Медицинская генетика. – 2022. – Т. 21. – №. 9. – С. 22-27.
2. Клинические рекомендации. Кистозный фиброз (муковисцидоз). МЗ РФ. – 2025.
3. Chen Q., Shen Y., Zheng J. A review of cystic fibrosis: Basic and clinical aspects //Animal models and experimental medicine. – 2021. – Т. 4. – №. 3. – С. 220-232.
4. Grasemann H, Ratjen F. Cystic Fibrosis //N Engl J Med. – 2023. – Т. 389. – №. 18. – С. 1693-1707.
5. Mall M. A. et al. Cystic fibrosis Nat Rev Dis Primers 10: 53 [Электронный ресурс].

Правила подготовки к исследованию

Специальной подготовки не требуется.

Показания для анализа «Муковисцидоз. Поиск частых мутаций в гене CFTR, ч. м.»:

• диагностика муковисцидоза и CFTR-ассоциированных заболеваний;
• определение риска рождения ребенка с муковисцидозом при планировании беременности;
• диагностика мужского бесплодия.

Интерпретация результатов исследований содержит информацию для лечащего врача и не является диагнозом. Информацию из этого раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. Точный диагноз ставит врач, используя как результаты данного обследования, так и нужную информацию из других источников: анамнеза, результатов других обследований и т.д.

Единицы измерения: нет.

Референсные значения: нет.

Формат представления результата

Качественный.

Возможные варианты результата: ОБНАРУЖЕНО, НЕ ОБНАРУЖЕНО.

Интерпретация результатов исследования «Муковисцидоз. Поиск частых мутаций в гене CFTR, ч. м.»

Норма

У пациента не обнаружены патогенные варианты c.350G>A (p.Arg117His), IVS8-5T (c.1210-12T[5]), c.2051_2052del, c.2051_2052dup, c.2051_2052delinsG, c.3808del, c.3767dup, c.3773dup, c.3851_3852dup, c.243del, c.233del, c.233dup, c.410_416del, c.409_412del, c.424del, c.429del, c.433del, c.459_476del (p.Ala155_Ile160del), c.488del, c.3883_3886del, c.1543_1555del, протяженная делеция CFTRdel2,3 (c.54-5940_273+10250del), 2143delT (c.2012del), 2184insA (c.2052dup), 3821delT (c.3691del), 3944delGT (c.3816_3817del), 4015delA (c.3883del), 4022insT (c.3891dup), 394delTT (c.262_263del), L138ins (c.413_415dup; p.Leu138dup), 604insA (c.472dup), F508del (c.1521_1523del; p.Phe508del), I507del (c.1519_1521delATC; p.Ile507del), 1677delTA (c.1545_1546del; p.Tyr515_Arg516delinsTer), W1282X (c.3846G>A; p.Trp1282Ter), G542X (c.1624G>T; p.Gly542Ter), N1303K (c.3909C>G, p.Asn1303Lys), c.3718-2477C>T, R334W (c.1000C>T; p.Arg334Trp), S1196X (c.3587C>G;p.Ser1196Ter), 621+1G>T (c.489+1G>T), E92K (c.274G>A; p.Glu92Lys), 3272-26A>G (c.3140-26A>G), 2789+5G>A (c.2657+5G>A), 3272-16T>A (c.3140-16T>A), S466X (c.1397C>G; p.Ser466Ter), 1898+1G>A (c.1766+1G>A), 3120+1G>A (c.2988+1G>A), R347P (c.1040G>C; p.Arg347Pro), S945L (c.2834C>T; p.Ser945Leu) в гене CFTR. Используемые референсные последовательности: CFTR — NM_000492.3.

Отрицательный результат исследования значительно снижает вероятность наличия у пациента CFTR-ассоциированных состояний, таких как муковисцидоз, двусторонняя врожденная аплазия семявыносящих путей, наследственный CFTR-ассоциированный панкреатит, CFTR-ассоциированные диссеминированные бронхоэктазы, CFTR-ассоциированный синусит, синдром псевдо-Барттера, однако не исключает их полностью, поскольку описано около 2000 патогенных вариантов в гене CFTR. При сохранении подозрения на наличие у пациента CFTR-ассоциированных состояний рекомендуется исследование всей последовательности гена CFTR методом NGS.

Не норма

Обнаружение гетерозиготного варианта в гене CFTR не подтверждает у пациента CFTR-ассоциированное заболевание. Распространенность носительства патогенных вариантов составляет 1:34. Однако при высоком уровне подозрения на заболевание, а также при наличии характерной клинической симптоматики выявление гетерозиготного варианта увеличивает вероятность наличия таких состояний, как муковисцидоз, двусторонняя врожденная аплазия семявыносящих путей, наследственный CFTR-ассоциированный панкреатит, CFTR-ассоциированные диссеминированные бронхоэктазы, CFTR-ассоциированный синусит, синдром псевдо-Барттера, так как обязательным условием постановки данных диагнозов является наличие хотя бы одного идентифицированного патогенного изменения в гене CFTR. В таких случаях требуется расширенное генотипирование гена CFTR для выявления второго патогенного варианта.

Гомозиготный патогенный вариант гена CFTR подтверждает диагноз CFTR-ассоциированного заболевания.

При обнаружении двух гетерозиготных патогенных вариантов рекомендуется обследование родителей для подтверждения локализации вариантов на разных хромосомах. При наличии у пациента характерной клинической картины и подтверждения транс-расположения вариантов данный генотип подтверждает CFTR-ассоциированное состояние. Выявленный генотип может демонстрировать неполную пенетрантность: у носителей не всегда гарантированно развиваются клинические проявления заболевания в течение жизни. Кроме того, выявленный генотип может вызывать различную клиническую картину у разных пациентов и характеризоваться вариабельностью проявлений и симптомов даже у членов одной семьи.

Данный тест позволяет выявлять самые распространенные в российской популяции патогенные варианты: c.350G>A (p.Arg117His), IVS8-5T (c.1210-12T[5]), c.2051_2052del, c.2051_2052dup, c.2051_2052delinsG, c.3808del, c.3767dup, c.3773dup, c.3851_3852dup, c.243del, c.233del, c.233dup, c.410_416del, c.409_412del, c.424del, c.429del, c.433del, c.459_476del (p.Ala155_Ile160del), c.488del, c.3883_3886del, c.1543_1555del, протяженную делецию CFTRdel2,3 (c.54-5940_273+10250del), 2143delT (c.2012del), 2184insA (c.2052dup), 3821delT (c.3691del), 3944delGT (c.3816_3817del), 4015delA (c.3883del), 4022insT (c.3891dup), 394delTT (c.262_263del), L138ins (c.413_415dup; p.Leu138dup), 604insA (c.472dup), F508del (c.1521_1523del; p.Phe508del), I507del (c.1519_1521delATC; p.Ile507del), 1677delTA (c.1545_1546del; p.Tyr515_Arg516delinsTer), W1282X (c.3846G>A; p.Trp1282Ter), G542X (c.1624G>T; p.Gly542Ter), N1303K (c.3909C>G, p.Asn1303Lys), c.3718-2477C>T, R334W (c.1000C>T; p.Arg334Trp), S1196X (c.3587C>G;p.Ser1196Ter), 621+1G>T (c.489+1G>T), E92K (c.274G>A; p.Glu92Lys), 3272-26A>G (c.3140-26A>G), 2789+5G>A (c.2657+5G>A), 3272-16T>A (c.3140-16T>A), S466X (c.1397C>G; p.Ser466Ter), 1898+1G>A (c.1766+1G>A), 3120+1G>A (c.2988+1G>A), R347P (c.1040G>C; p.Arg347Pro), S945L (c.2834C>T; p.Ser945Leu). Используемые референсные последовательности: CFTR — NM_000492.3.