Полноэкзомное секвенирование панели генов наследственных форм болезни двигательных нейронов (Whole exome sequencing of a gene panel for hereditary forms of motor neuron disease)

Синонимы: Исследование панели генов наследственных форм болезни двигательных нейронов по результатам полноэкзомного секвенирования.

Study of gene panel for inherited forms of motor neuron disease using whole-exome sequencing data.

Спинальная мышечная атрофия и ее генокопии

Боковой амиотрофический склероз и его генокопии

Спастическая параплегия и её генокопии

Другие наследственные заболевания, вовлекающие моторные нейроны

Краткое описание исследования «Полноэкзомное секвенирование панели генов наследственных форм болезни двигательных нейронов»

Болезни двигательных нейронов (мотонейронов) – это группа неврологических заболеваний, характеризующихся поражением верхнего и/или нижнего мотонейронов с последующим развитием специфической неврологической симптоматики.

Причины поражения мотонейронов

Поражение мотонейронов может возникать:

• при паранеопластических состояниях;
• при инфекциях;
• при метаболических нарушениях;
• при токсическом поражении;
• при аутоиммунных и иммуноопосредованных состояниях;
• может быть генетически-детерминированным.

Наиболее частой генетической формой болезни мотонейронов является боковой амиотрофический склероз. Другими частыми причинами являются спинальная мышечная атрофия и спастическая параплегия. Также поражение двигательного нейрона может наблюдаться при некоторых системных наследственных заболеваниях, таких как болезнь Тея-Сакса и др.

Что такое полноэкзомное секвенирование?

Полноэкзомное секвенирование – это высокотехнологичный метод анализа ДНК, прочитывающий все белок-кодирующие участки генома (экзом), содержащие ~85% известных мутаций (патогенных вариантов). Полноэкзомное секвенирование выявляет:

• однонуклеотидные замены (SNV);
• малые инсерции/делеции (in/del) до 50 п.н.;
• некоторые вариации числа копий (CNV).

Когда исследование затруднено

Выявление некоторых типов вариантов методом экзомного секвенирования затруднено или невозможно. К таким вариантам относятся:

• структурные изменения хромосом (инверсии, транслокации, делеции, амплификации);
• полиплоидии;
• анеуплоидии;
• варианты, ассоциированные с протяженными участками триплетных и других повторов;
• варианты в генах с наличием в геноме близкого по последовательности псевдогена или паралога;
• варианты в GC-богатых участках;
• варианты в интронах за пределами канонических сайтов сплайсинга;
• эпигенетические варианты.

Метод имеет ограниченную чувствительность в отношении вариантов в состоянии мозаицизма.

Выполнение полноэкзомного секвенирования показано:

• когда клиническая картина заболевания гетерогенна и предполагает дифференциальный диагноз в рамках широкого спектра генетически-детерминированных заболеваний;
• когда заболевание является наследственным, но количество потенциальных генов-кандидатов велико;
• когда другими базовыми методами (кариотипирование, «точечное» генетическое обследование) не удалось установить причину заболевания, но есть высокая вероятность его генетической природы.

С какой целью выполняют исследование

С целью диагностики при наличии неврологической картины поражения двигательных нейронов в случае, когда предполагается генетическая причина заболевания (спинальная мышечная атрофия, боковой амиотрофический склероз, спастическая параплегия и др.

Литература

1. Журкова Н. В. и др. GM2-ганглиозидоз, тип I (болезнь Тея-Сакса) в практике педиатра //Педиатрическая фармакология. – 2020. – Т. 17. – №. 6. – С. 529-535.
2. Клинические рекомендации. 5q-ассоциированная спинальная мышечная атрофия. МЗ РФ. – 2024.
3. Клинические рекомендации. Боковой амиотрофический склероз и другие болезни двигательного нейрона (БАС/БДН). МЗ РФ. – 2024.
4. Meyyazhagan A., Orlacchio A. Hereditary spastic paraplegia: an update //International Journal of Molecular Sciences. – 2022. – Т. 23. – №. 3. – С. 1697.
5. Riva N. et al. Update on recent advances in amyotrophic lateral sclerosis //Journal of neurology. – 2024. – Т. 271. – №. 7. – С. 4693-4723.

Правила подготовки к исследованию

Специальной подготовки не требуется.

Показания для анализа «Полноэкзомное секвенирование панели генов наследственных форм болезни двигательных нейронов»:

• неврологическая картина поражения двигательных нейронов в случае, когда предполагается генетическая причина заболевания (спинальная мышечная атрофия, боковой амиотрофический склероз, спастическая параплегия и др.);
• обследование кровных родственников пациента с доказанной генетической формой болезни двигательных нейронов.

Интерпретация результатов исследований содержит информацию для лечащего врача и не является диагнозом. Информацию из этого раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. Точный диагноз ставит врач, используя как результаты данного обследования, так и нужную информацию из других источников: анамнеза, результатов других обследований и т.д.

Единицы измерения: нет.

Референсные значения: нет.

Формат представления результата

Качественный.

Интерпретация результатов исследования «Полноэкзомное секвенирование панели генов наследственных форм болезни двигательных нейронов»

Информация по интерпретации предоставляется на отдельном бланке.